MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p2ESCUM

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011739	A	6	6	1	6	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011739	ATG	2	6	15	20	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011739	ATG	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011739	ATG	2	6	59	64	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011739	ATG	2	6	81	86	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011739	ATG	2	6	103	108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011739	ATG	2	6	125	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011739	ATT	2	6	142	147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011739	GCT	2	6	226	231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011739	ATG	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011739	GAT	2	6	2260	2265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011739	TAAT	2	8	2348	2355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011739	TGC	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011739	ACA	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011739	TA	3	6	2454	2459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011739	T	7	7	2477	2483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011739	AGT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011739	GAT	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011739	AT	5	10	2495	2504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011739	ATT	2	6	2832	2837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011739	TCT	2	6	2859	2864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011739	CTT	3	9	2887	2895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011739	TA	3	6	2918	2923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011739	TAT	2	6	3260	3265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011739	CAAT	2	8	3322	3329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011739	TGC	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011739	CAA	2	6	3364	3369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011739	GT	3	6	3682	3687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011739	ATG	2	6	4052	4057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011739	ATC	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011739	GT	3	6	4078	4083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011739	AAT	2	6	4084	4089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011739	GT	3	6	4778	4783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011739	TGA	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011739	GT	3	6	4849	4854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011739	ATT	2	6	4855	4860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011739	A	7	7	5774	5780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011739	T	6	6	5791	5796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011739	CAGGG	2	10	5833	5842	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011739	GGAAC	2	10	5913	5922	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011739	TGT	2	6	5930	5935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011739	CGAT	2	8	6058	6065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011739	TGT	2	6	6089	6094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011739	GTT	2	6	6110	6115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011739	CGG	2	6	6161	6166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011739	GCTG	2	8	6937	6944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011739	ATT	2	6	6994	6999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011739	TAAT	2	8	7466	7473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011739	TTA	2	6	9840	9845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011739	CCT	2	6	10790	10795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011739	GCC	2	6	10805	10810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011739	GTT	2	6	12228	12233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011739	GCG	2	6	12269	12274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011739	CAG	2	6	18997	19002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011739	AGT	2	6	19092	19097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011739	ATA	2	6	19101	19106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011739	AGA	2	6	19137	19142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011739	TTC	2	6	25335	25340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011739	TC	3	6	25364	25369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011739	CTT	2	6	25395	25400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011739	TGT	2	6	25401	25406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011739	TTTG	2	8	25464	25471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011739	TCT	2	6	25512	25517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011739	TTA	2	6	25576	25581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011739	CGA	2	6	25677	25682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011739	GTG	2	6	25761	25766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011739	T	6	6	25792	25797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011739	T	6	6	26001	26006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011739	ATG	2	6	26022	26027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011739	TAAAA	2	10	26082	26091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011739	TTTC	2	8	26095	26102	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011739	AT	3	6	26110	26115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011739	AT	3	6	28107	28112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011739	GCA	2	6	30051	30056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011739	GGGCG	2	10	30057	30066	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011739	GCT	2	6	31169	31174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011739	GGCT	2	8	31211	31218	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011739	ATA	2	6	31219	31224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011739	GCA	2	6	32131	32136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011739	AC	3	6	32239	32244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011739	AC	3	6	32279	32284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011739	CGGG	2	8	32343	32350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011739	GA	3	6	32400	32405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011739	GCC	2	6	33092	33097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011739	A	6	6	33150	33155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011739	TG	3	6	33186	33191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011739	T	6	6	33268	33273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011739	CGC	2	6	33314	33319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_011739	TTG	2	6	33339	33344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011739	T	6	6	33458	33463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011739	TGT	2	6	33486	33491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011739	CGAA	2	8	33494	33501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011739	ATCA	2	8	33548	33555	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011739	TGT	2	6	33651	33656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011739	TG	3	6	33662	33667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011739	TCC	2	6	33692	33697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011739	TCT	2	6	33750	33755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.